祝由之法，即包括中草药在内的，借符咒禁禳来治疗疾病的一种方法。“祝”者咒也，“由”者病的原由也。“祝由”的概念很广，包括禁法、咒法、祝法、符法，以及暗示疗法、心理疗法、催眠疗法、音乐疗法等，并非仅仅祝其病由而愈其病。有些病原因已明，可是祝之不愈，这说明祝法不起作用，就要改用禁法，或符法，或配合药物治疗。
祝由十三科包含：一曰大方脉科，主治伤寒痰喘，及一切内症。 二曰诸风科，主治麻木痈痪，及一切中风。 三曰胎产科，主治胎前产後诸病，及一切妇科异症。 四曰眼目科，主治青盲白翳，及流行眼疾。 五曰小儿科，主治惊风潮热，及一切幼科杂症。 六曰口齿科，主治牙痛鱼鲠，及一切喉症。 七曰痘疹科，癰疽疔毒，及淋浊科。 八曰伤折科，主治压伤骨断，及跌打损伤。 九曰耳鼻科，主治耳聋鼻衄及一切耳鼻病。 十曰疮肿科，主治癞疥顽癣，及无名肿毒。 十一曰金簇科，主治箭伤枪伤，及刀斧铁器伤。 十二曰书禁科，主治镇邪驱鬼，及辟毒截疮。 十三曰砭针科，主治疯癫，及筋骨疼痛。
疗法：
祝由治病不用药或少用药，而主用祝由师的意念、符咒产生的场来治疗各种疾病，因此祝由科对祝由医师要求很高、很严，有很多戒律必需遵守。这些要求实际上就是现代气功训练的要求。祝由要求祝由医师清净斋戒百日，目的是使内心平静，心无杂念，意念专一，以达到祝由场纯正，没有邪念浊气干扰，以提高疗效。气功师较佳的功态就是祝由医师治病的先决条件，只须看一看，就可以手到病除，咒出病愈，符进病出。祝由医师必须练气功来提高自己的人体场，才能借助咒语，符图使大自然的能量冲射病变部位，排出病邪、浊气，补充元气，疏通经络，调和脏腑功能。没有相当的气功底子，用祝由“画符念咒”为人治病，无疑是骗人的。学习祝由法必须练气功，可以任选合适的功法。以前有功夫底子的可以坚持练以前的功法，尚未学习者或发放外气不明显者，就应该练习下面的《祝由气功医师速成法》：
坐站均可。两掌心相对，左右隔开三五厘米，指尖相对。二目垂帘，内视掌中，仔细体察双掌感应。双掌轻松地缓慢地作磨盘式对称转动，几秒种或几分钟后，会有气的感觉。能否达到速效，关键在于是否能将全身放松，并将意念集中于掌上仔细体会，有气感时，进一步体会有无排斥力或吸引力，反复练此动作 108 次。当练到一定程度时，好像自己全身任督二脉也在开合，直到每一个毛孔 ( 细胞 ) 都在开合，在呼吸，在交换，在代谢，把大自然的清气、宇宙场收入人体，排出体内的废物。反复训练增强功力，有利于以后运用符图咒语时手到病除，意到病出，气到病愈。以上这些训练动作不但调整自身的生物场，也可调动宇宙场 ( 包括祝由先师们的高能信息物质 ) 进入人体，使气贯注于指端，直达笔毫，深透墨纸之中，或以指代笔书符咒于病灶之上。
祝由科禁法
禁者即禁止、防止泛滥发展、控制之意。禁法是以咒语产生的能量、次声波来限制疾病的发生发展，抑制病灶，使病灶逐渐缩小，直至消失。现代医学也是这个原理。如抗菌素不是直接杀死细菌，而是抑制病菌生长，久而久之病菌就会死亡，这也是西医药的禁法。祝由科中禁法即是祝由医师用自己良性生物场抑制控制疾病的发生发展，使病灶逐渐消退病愈。
祝由符图
祝由科的内容极为丰富，在古时候，在缺医少药的环境中，以图示意，以咒代药，以符接通信息是最简单的医疗保健方法。这是古人发现的一种人与宇宙相沟通的能量符号，掌握了这种神秘的能量符号，就可以定向调动宇宙场，为人类身心健康服务。符图的主要特点：
1 、有很多是以象形文字构成。
2 、以文字中的篆体构图。
3 、以疾病的部位、病性构图如脾胃、水湿病图中多用“土”字形，心脏、肝脏、肺脏病图形符中多“火”字形，因为“土”能生脾胃，可以克水；“火”能温煦心脏，可以克金，与中医的五行取类比象有很大关系。
4 、以“鬼”字居多，以“鬼”招“鬼”，即俗话说的“鬼使神差”，其实都是人的意识思维活动。
5 、这些符图构造渗透、储存、连接了古代高功夫师、医学家的高能信息，是宇宙中的物体能量符号，是人与宇宙能量交换的开关。
6 、符图中呈圈状、点状、线条状、直线、竖线、 S 线、口字等，这些都是宇宙能量的符号，“同气相求”，开关一打开，宇宙能量就会定向定目标的射入患者病灶。
祝由咒法
祝者咒也，诅咒就是说最不好听的话，发出的信息也最不好，可以干扰一个人的场，场受到干扰，大脑就易于失控。所以说咒语威力是相当大的，是最神秘的。祝由医师要用咒语诅咒病魔，将病魔赶出人体，咒语是具有攻击性，驱散性的。咒语是练功人练到一定程度时，所发出的特定声音，这些声音，以次声波为多，对人体可以产生共振，共振效果好就可以达到治疗效果。刚开始可以按照特音(咒语) 来治病，熟练后，能量高了，就不要特音了(咒语好比拐杖，可以丢掉拐杖 ) ，而随便讲的话，讲的任何语言都可以治疗疾病。但语言必须是良性的，不要有邪念和恶意或病变意念。